Нитрат — это ион, доставляющий кучу неудобств упорным любителям аквариумистки. Азот, входящий в его состав, приходит вместе с пищевыми компонентами, и в ряде видов аквариумов его содержание возрастает, что  трудно дает поддержание его на пониженном, как в океане, уровне. Десять или двадцать лет назад, многие аквариумисты меняли часть воды в аквариуме с одной лишь целью — снизить количество нитратов. К счастью, сегодня нам представлено много способов поддержания низкого уровня нитратов, и новейшие аквариумы подвержены образованию нитратов гораздо меньше, чем в прошлом.

Нитраты зачастую имеют аналогию с морскими водорослями, и действительно, росту морских водорослей в основном способствует переизбыток питательных веществ, в т.ч. нитратов. То же самое можно отметить и в отношении прочих потенциальных вредителей в аквариуме, вроде динофлагеллата. Сам нитрат — не очень-то ядовит в концентрациях, стандартно достигаемых в аквариумах, по крайней мере, об этом не имеется данных в научной литературе. Однако  повышенный уровень нитратов приводит к повышенному росту зооксантеллы, которые, в свою очередь, могут практически подавить роста кораллов.

По этим причинам, большая часть аквариумистов, которые содержат риф, желают понизить уровень нитратов. Одни — довольно успешно, другие — нет. Азот имеется в океане в различных своих формах, одна из которых — нитраты. Другие его формы — молекулярный азот (N2), аммиак (NH3/NH4+), нитриты (NO2-) и несметное число органических форм. Из неорганических разновидностей, нитраты имеют  чаще всего распространение, но не всегда в больших его концентрациях. Концентрация в океане сильно меняется от места к месту, а также зависит от глубины.