Знания в отношении биологических и экологических особенностей коньков-пигмеев до сих пор остаются на элементарном уровне. Но на современном этапе возможностей изучения этих крошечных существ появляется все больше и больше. Так, обнаружено, что Hippocampus bargibanti, H. colemani, H. pontohi, H. satomiae и H. Severnsi имеют сходства в строение и размерах тела, что может предполагать их родственные отношения. Ученые предполагают, что они имеют общего предка, а эволюционное разветвление началась совсем недавно.
А вот у другой разновидности коньков-пигмеев H. Minotaur значительно большие размеры тела, помимо этого у H. Minotaur есть ряд особенностей 41 хвостовое кольцо, 8-9 колец тела, от 7 до 9 спинных и 11 грудных плавниковых лучей. Коньки этого вида сильно сплюснуты по бокам и имеют толстую шею.
В целом, специфическая среда обитания влияет на все виды морских коньков – пигмеев, а именно на их окрас, вырост и пропорции тела. Диапазон их обитания обширен – это и горгонарии, и морская трава, и колониальные гидроиды, и мшанки и коралловые морские водоросли, а так же поверхность жестких кораллов, губок и скальные расщелины.
Допустимо, что естественный отбор среди морских коньков-пигмеев способствовал разделению их среды обитания, видообразованию и камуфлированию. На данный момент известно семь видов морских коньков-пигмеев, однако не секрет, что в скором времени мы будем свидетелями открытия новых видом этих необычных морских обитателей.